埃博拉病毒病通常突然发生,常出现前额疼痛,进行性加重,而且比恶性疟感染时更严重,播散到枕骨。总是出现发热和虚弱,早期就出现肌痛;大关节痛从起病开始就经常发作,严重的全身性疾病在一两天左右紧接着出现。病人出现嗜睡、面无表情、眼眶深陷;紧接着出现食欲减退,有时伴有呕吐和体重迅速下降,形成几乎僵硬的面容。在两三天内,出现胃肠道症状,常伴有痉挛。 在稍后的阶段,尤其是有出血表现的病人,粪便中可见鲜血。常伴有呕吐,接近半数的病人有出血体征;呕吐物常为鲜血或暗红色的血液(见黄热病的黑色呕吐物)。其他常见症状包括咽喉疼痛和吞咽困难, 唇裂和开放性口疮,结膜炎,有时伴有结膜下出血,还有咳嗽。一些病例中还出现黄疸。胰腺炎(临床诊断)也常常出现,在82例被传染的孕妇中23%出现了流产。在许多病人和超过半数的死亡病例中有出血表现,可能由弥散性血管内凝血(DIC)造成。死亡最早出现在发病后第4天,但更常见的是在第5或第6天,偶然也见第20天出现死亡的病例。