阿米巴侵入到大肠的黏膜层和黏膜下层,产生特征性烧瓶状损伤时,会引发疾病。除了对肠道产生严重甚至可能致命的损伤外,阿米巴有时还会穿过大肠的肌层,由此进入血液并被运载到其他器官,尤其是肝脏。阿米巴还可以由肝脏穿过膈肌进入肺,并在肺内形成新的脓肿。也可能发生极具破坏性的皮肤溃疡,尤其在肛门周围。 阿米巴痢疾的诊断有赖于粪便的显微镜下检查、血清学检查以及临床症状的观察。最可靠的方法是在粪便中发现滋养体或包囊。即便用现代化的仪器设备和染色技术,这项工作仍显繁琐,而且需要相当的技巧。滋养体只有在新鲜标本中才能保持活性,并且必须与共栖性物种和白细胞鉴别开来。虽然保存的粪便标本也许经过了浓缩与染色,但是对其进行成虫和包囊的检测以及准确鉴定,操作起来依然十分困难。另外,由于滋养体和包囊并不是连续排出体外的,因而必须检查多个标本。 鉴别诊断时必须排除细菌性痢疾的可能。阿米巴痢疾更趋于是一种起病缓慢、低热或不发热的慢性疾病。粪便量较多,但次数较少,并且不会呈现出细菌性痢疾中常见的亮红色血液。阿米巴痢疾的潜伏期稍长一些,通常为20~90天,甚至更长,而细菌性痢疾则为7天或更短。由于细菌性痢疾的潜伏期较短,并且更容易通过水传播,因而暴发流行的可能性更大。