泌尿系非特异性感染常见的病原菌主要为革兰氏阴性杆菌，如大肠肝菌和变形杆菌等。亦有革兰氏阳性球菌，如金黄色葡萄球菌。
泌尿系感染的感染途径：
（1）上行性感染：致病菌经尿道进入膀胱，然后沿输尿管上往至肾脏。
（2）血行感染：细菌从身体其他部位的感染病灶经血运传播至泌尿系统。
（3）淋巴途径感染：致病菌从附近病灶通过淋巴管传播至泌尿系。
〔4）直接感染：细菌直接来自邻近有感染的器官，如阑尾脓肿、盆腔化脓性炎症。感染亦可来自外来部，如直接通过瘘道或造瘘管使泌尿系感染。
泌尿系感染时应用扰菌药物的原则：
（1）根据尿培养及药敏试验结果选用敏感度高、且尿液中浓度高的抗菌药物，以迅速达到尿液无菌，然后维持7-10天。过早停药可导致感染复发。
（2）为避免耐药菌株的产生，应同时应用两种或两种以上扰菌药物。
（3）当无细菌学检查资料时，可根据尿沉渣涂片革兰氏染色对病菌类别作出初步估计，选择适当药物。当并有肾功能损害时，宜选择对肾毒性小，积蓄少的药物。
（4）抗菌药物必须和其他治疗方法配合应用，以提高疗效。如调整尿液的pH值，解除尿路梗阻等。