每日手术前及手术后用石英紫外线灯管照射手术间空气1h，连台手术必须照射30min后，方能进行下一台手术，紫外线灯管的强度应定期测定，凡低于70μW/cm2的灯管必须及时更换。
每月必须彻底作手术间空气重蒸消毒并作消毒灭菌效果监测，结果>200cfu/m3（层流洁净手术室>10cfu/m3），或查到金黄色葡萄球菌等致病菌的手术间，均应重新消毒，合格后方可使用。
空气消毒法：消毒前先做好清洁工作。一般选用过氧乙酸（电动喷雾法或加热蒸气法）或紫外线照射法。甲醛溶液蒸气消毒后刺激性气雾持续较久，不适于急用的手术间消毒。乳酸消毒法效果较差，不宜应用。