分为三期：发冷期、发热期、出汗期。
1.发冷期 骤感畏寒，先为四肢末端发凉，迅觉背部、全身发冷。皮肤起鸡皮疙瘩，口唇，指甲发绀，颜面苍白，全身肌肉关节酸痛。进而全身发抖，牙齿打颤，有的人盖几床被子不能制止。持续约10分钟，乃至一小时，寒战自然停止，体温上升。此期患者常有重病感。
2.发热期 冷感消失以后，面色转红，紫绀消失，体温迅速上升，通常发冷越显著，则体温就愈高，可达40℃以上。高热患者痛苦难忍。辗转不安，呻吟不止；谵妄，撮空，甚至抽搐或不省人事；剧烈头痛、顽固呕吐。患者面赤、气促；结膜充血；皮灼热而干燥；脉洪而速；尿短而色深。多诉说心悸，口喝，欲冷饮。持续2～6小时，个别达10余小时。发作数次后唇鼻常见疱疹。
3.出汗期 高热后期，颜面手心微汗，随后遍及全身，大汗淋漓，衣服湿透，约2～3小时体温降低，常至35.5℃。患者感觉舒适，但十分困倦，常安然入睡。一觉醒来，精神轻快，食欲恢复，又可照常工作。此刻进入间歇期。
整个发作过程约6～12小时，典型者间歇48小时又重复上述过程。一般发作5～10次，因体内产生免疫力而自然终止。
（四）实验室检查
1.血象 红细胞和血红蛋白在多次发作后下降，恶性疟尤重；白细胞总数初发时可稍增，后正常或稍低，白细胞分类单核细胞常增多，并见吞噬有疟色素颗粒。
2.疟原虫检查
（1）血液涂片（薄片与厚片）染色查疟原虫。并可鉴别疟原虫种类。
（2）骨髓涂片染色查疟原虫，阳性率较血片高。
3.血清学检查 抗疟抗体一般在感染后2～3周出现，4～8周达高峰，以后逐渐下降。
现应用间接免疫荧光、间接血凝与酶联免疫吸附试验等，阳性率可达90%。一般用于流行病学检查。
（五）治疗
1.控制临床发作的药物 氯喹是首选药物。对各种疟原虫红细胞内裂殖体有迅速而强效的杀灭作用。奎宁的疗效不及氯喹，主要用于耐氯喹的疟原虫感染。甲氟喹对各种疟原虫红细胞内期裂殖体均有杀灭作用。磷酸咯萘啶对恶性疟和间日疟原虫有较强的杀灭作用。青蒿素及其衍生物则是我国研制的抗疟药。它的显著特点是速效、低毒、无交叉抗药性。对间日疟和恶性疟原虫，包括耐氯喹的红细胞内裂殖体都有强效的杀灭作用。现已有一些青蒿素衍生物制剂，如蓄甲醚、青蒿琥酯等。
2.防止复发和传播的药物 伯氨喹能杀灭肝细胞内的速发型和迟发型疟原虫，有病因预防和防止复发的作用，但对红细胞内裂殖体的作用差，不能单独用于控制发作。
3.用于预防的药物 乙胺嘧啶能杀灭各种疟原虫的裂殖体，对红细胞内期末成熟的裂殖体有抑制作用，但对已成熟的裂殖体无效，故控制发作效果较慢。
（六）预防 保护易感人群的措施。
保护易感者，服药预防。进入疟区，特别是流行季节，在高疟区必须服药预防。
一般自进入疟区前2周开始服药，持续到离开疟区6～8周。下列药物可据条件酌情选用：
1.乙胺嘧啶 4片每周一次，或8片每两周一次。长期服用可致巨细胞性贫血，还可产生耐受性。（乙胺嘧啶每片6.25mg）。
2.哌喹或磷酸哌喹 服基质0.6g，每20～30天服1次。耐氯喹地区也可采用。
3.复方防疟药 防疟片1号，含乙胺嘧啶20mg，氨苯砜100mg，第1、2日每日1片，以后每周1片。防疟片2号，每片含乙胺嘧啶17.5mg，磺胺多辛250mg，第1、2日每日2片，以后每10日2片。防疟片3号，含磷酸哌喹250mg，磺胺多辛50mg，每月1次，每次4片。
4.氯喹 2片，每10日1次，接受输血者可服氯喹每日（1片）基质0.15g，连服3～5日。