医学论文是传播精神文明，推进科学发展的载体；是医学科研和临床的书面总结；是进行工作总结、交流和提高医疗技术水平的重要工龄，医学论文的质量高低是反映医学科学水平和动向的重要标志。
一篇好的医学论文，要求具备两个方面：其一是论文内容的科学性、先进性、实用性；其二是写作技巧上要文字简洁、观点鲜明、图表恰当。
撰写医学论文的基本要求
科学性：一篇医学论文的首要条件是必须有科学性。所谓科学性是指论文所介绍的方法、论点，是否用科学方法来证实，是否经得起实践的考验。这就要求：⑴进行科研设计时即有周密的考虑，排除一切对结果可能干扰的不利因素；⑵要设立必要的对照组，甚至双盲对照研究；⑶对实验和观察的数据，要进行统计学处理；⑷无论理论研究和实验研究，对其结果的分析要从实际资料出发，得出恰当的结论，切忌空谈设想和抽象推理。
先进性（创造性）：论文的先进性，实际上是指这篇论文是否达到一定的科学水平，一篇论文尽管具备了科学性，但不一定是先进的，因为这个工作可能在数年前甚至十几年前已被别人证实过了，所以医学论文的先进性，我们可以从两个方面来衡量，一是理论水平，如原理探讨，疗效机制等是否有新的突破；二是实践水平，如诊断水平或治疗效果是否高于一般水平及技术操作是否特别先进。但不论是实践水平或是理论水平的衡量，均应与同类成果当时的现有的水平相比较，如与国外的、国内的、本地的同类课题水平比较才能给予评价。
实用性（应用性）：一是与临床联系的课题，二是可重复性。
医学论文的类型
一般医学刊物中刊用的文章，大致可分为以下几种类型：述评、论著（论著摘要、实验研究、诊断技术等），病（例）现报告，临床病（例）理讨论、学术交流、综述、专题笔谈、经验介绍、讲座、简讯等。
医学论文的基础结构
医学论文（论著）的具体撰写，一般可分为题目、序言、材料与方法、结果、讨论、参考文献等项。
题目：论文的题目必须切合内容而简明扼要、突出重点，能够明确表达论文的性质和目的。题目一般都采用主要由名词组成的词组来表达，且标题不宜过长（一般少于20字）。
摘要：全文通过什么方法，得到什么结果，资料数据，提出有意义的结论（包括阳性及阴性）。具体按四要素来书写中、英文摘要：目的（Objectives）、方法（Methods）、结果（Results）、结论（Results）、结论（Conclusions），中英文内容要一致。字数控制在200字左右。关键词或主题词3～5条。英文摘要尚应包括文题、作者姓名（汉语拼音）、单位名称、所在城市名及邮政编码。作者应列出前3位，3位以上加“et al”。
序言：过去研究的情况、方法、目的和所获得的主要成果或特点。这段文字不宜超过100～200字。
材料和方法：这是执行科研的关键部分，对于要进行的研究工作，必须按照实际情况，在事先：⑴选择好合适的即合乎一定条件的、一定数量的研究对象；⑵采用一定的实验、诊断或治疗方法（包括实验步骤、方法、器材试剂、药品）；⑶经过一定时期的观察，相同条件下的对照组，与他人结果比较并综合分析。这部分内容要求简明准确、材料完整及可信。
结果：把全部原始资料集中起来，在处理这些原始资料时，应是随机，客观地加以分析，不应有意无意地加以挑选。对于一些阴性结果，不必一一列出。尽量组织严密，符合逻辑、进行对比观察。
讨论：论文中很重要的部分，其主要任务是探讨“结果”的意义。
讨论的主要内容包括：⑴主要的原理和概念；⑵实验条件的优缺点；⑶本人结果与他人结果的异同，突出新发现、新发明；⑷解释因果关系，说明偶然性与必然性；⑸尚未定论之处，相反的理论；⑹急需研究的方向和存在的主要问题。
“讨论”的内容也以精简为原则，要能讲清楚主要的论点，已经谈过的不宜在这一节里予以重复。在结论的问题中避免以假设来“证明”假设，以未知来说明未知，并依次循环推论。
参考文献：列出参考文献的目的，在于引证资料（包括观点、方法等）的来源，不可从别人的论文中转抄过来。
内部资料，非经正式发表者，一般不作文献引用，为此一般要求引用文献者必须用阅读过的重要的、近年的文献为准。论著10条左右，论著摘要3～5条，综述20条左右。
医学论文的产生过程
选题阶段：论文的选题，也即是科研的选题，有时一项科研可产生多篇论文。选题过程一般可分为三步：
初拟题目：在这项工作之前必须手中有信息、资料和设想，当然可以是前瞻性研究或回顾性总结，大致可有以下几个方面：⑴临床遇到的罕见病和疑难病例；⑵危重病人的诊治经验；⑶阅读国内外文献、参加学术会议受到的启发，进行技术和方法的移植研究；⑷新药、新仪器的临床应用，新的诊断方法及治疗经验；⑸上级布置或招标的题目。在初步考虑拟选题目之后，应进行全面的文献检索，避免题目类同、结论陈旧和不符合客观事实。在别人研究成果基础上寻找尚未解决的问题作为自己的研究题目。
实验研究阶段：这包括应用国外或国内的先进手段、药物、手术方法、检测等进行临床试用、观察和随访调查，并用动物或正常人作对照试验，要求详细记录各种数据及资料，作为论证和评价成果的依据。
整理、分析资料和总结阶段：对以上资料进行统计分析，绘制图表，临床分析和比较，得出显效、有效和生存率、死亡率、发病率等结论，并分析其相互关系，引证文献作对比。分析成功和失败的原因及制约因素，并对病因学、流行病学、发病机制进行论证，包括预后的估价。最后对论文作出自我评价，提出有待进一步探讨的问题。